Seqlog2xyz.exe - Versionsgeschichte

134.245.160.234 am 26. Februar 2009 um 11:57 Uhr

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	Kommandozeile. Beispiel:		Kommandozeile. Beispiel:
	seqlog2xyz -s .log -a 1 -z 20000 c12_mmp_pm3. > c12_mmp_pm3.seq.xyz		seqlog2xyz -s .log -a 1 -z 20000 c12_mmp_pm3. > c12_mmp_pm3.seq.xyz


	=== Longhelp ===		=== Longhelp ===

134.245.160.234: /* Synopsis */

2009-02-26T11:55:43Z

Synopsis

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	=== Synopsis ===		=== Synopsis ===
	Überführt eine Sequenz von Gaussian Rechnungen mit fortlaufender ~~Numerierung~~, wie z.B. erhalten aus [[xyz2com.tcl]] in eine Moleküldatenbank im xyz-Format. Kann die Ergebnisse mehrerer Rechnungen zusammenfassen und Werte wie NICS und MAGS in die Kommentarzeilen der einzelnen Strukturen schreiben.		Überführt eine Sequenz von Gaussian Rechnungen mit fortlaufender Nummerierung, wie z.B. erhalten aus [[xyz2com.tcl]] in eine Moleküldatenbank im xyz-Format. Kann die Ergebnisse mehrerer Rechnungen zusammenfassen und Werte wie NICS und MAGS in die Kommentarzeilen der einzelnen Strukturen schreiben.

	Nützlich für:		Nützlich für:

134.245.160.234: /* Synopsis */

2009-02-26T11:55:22Z

Synopsis

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	=== Synopsis ===		=== Synopsis ===
	Überführt eine Sequenz von Gaussian Rechnungen mit fortlaufender Numerierung, wie z.B. erhalten aus [[xyz2com.tcl]] in eine Moleküldatenbank im xyz-Format. Kann die Ergebnisse mehrerer Rechnungen zusammenfassen und Werte wie NICS und MAGS in die ~~Kommetnarzeilen~~ der einzelnen Strukturen schreiben.		Überführt eine Sequenz von Gaussian Rechnungen mit fortlaufender Numerierung, wie z.B. erhalten aus [[xyz2com.tcl]] in eine Moleküldatenbank im xyz-Format. Kann die Ergebnisse mehrerer Rechnungen zusammenfassen und Werte wie NICS und MAGS in die Kommentarzeilen der einzelnen Strukturen schreiben.

	Nützlich für:		Nützlich für:

134.245.160.234: Die Seite wurde neu angelegt: „=== Synopsis === Überführt eine Sequenz von Gaussian Rechnungen mit fortlaufender Numerierung, wie z.B. erhalten aus xyz2com.tcl in eine Moleküldatenbank i...“

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Die Seite wurde neu angelegt: „=== Synopsis === Überführt eine Sequenz von Gaussian Rechnungen mit fortlaufender Numerierung, wie z.B. erhalten aus xyz2com.tcl in eine Moleküldatenbank i...“

Neue Seite

=== Synopsis ===
Überführt eine Sequenz von Gaussian Rechnungen mit fortlaufender Numerierung, wie z.B. erhalten aus [[xyz2com.tcl]] in eine Moleküldatenbank im xyz-Format. Kann die Ergebnisse mehrerer Rechnungen zusammenfassen und Werte wie NICS und MAGS in die Kommetnarzeilen der einzelnen Strukturen schreiben.

Nützlich für:

* conformational search
* Annulene

=== Installation ===
* alle acid-Rechner
* [http://scholle.oc.uni-kiel.de/herges/download/arbeiten/koehler_dissertation_2008_install.zip Download ]
* Gitrepo: '''sftp://acid8/home/koehler/gitmaster/cpp_thesis'''

=== Usage ===
Kommandozeile. Beispiel:
seqlog2xyz -s .log -a 1 -z 20000 c12_mmp_pm3. > c12_mmp_pm3.seq.xyz

=== Longhelp ===
seqlog2xyz 1.0.3
Usage: seqlog2xyz STUB {-option, ...}
Converts multiple logfiles starting with STUB1, STUB2, ...
into an xyz file.
The sequence number is written into the comment.
Gaps in sequence are possible.
Copyright Felix Koehler 2004,2007
Options:
-h/-?: this help
-s: suffix
-a: Start index (default = 1)
-j: filestub for logsequence with indene-derivates
-k: filestub for logsequence with isoinden-derivates
-m: filestub for the logsequence containing the magnetical
exaltation. log files should be obtained by CSGT method.
-n: filestub for the logsequence containing the NICS values.
logfiles should be obtained by GIAO method.
-z: Stop index (default=10000)
-V: print version info
Hints: Providing the dot in STUB and suffix is usually necessary, eg.:
seqlog2xyz conformer_database. -a 1 -z 10000 -s .out