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<p><span class="autocomment">Synopsis</span></p> <table style="background-color: #fff; color: #202122;" data-mw="interface"> <col class="diff-marker" /> <col class="diff-content" /> <col class="diff-marker" /> <col class="diff-content" /> <tr class="diff-title" lang="de"> <td colspan="2" style="background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;">← Nächstältere Version</td> <td colspan="2" style="background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;">Version vom 26. Februar 2009, 11:43 Uhr</td> </tr><tr><td colspan="2" class="diff-lineno" id="mw-diff-left-l1">Zeile 1:</td> <td colspan="2" class="diff-lineno">Zeile 1:</td></tr> <tr><td class="diff-marker"></td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div>=== Synopsis ===</div></td><td class="diff-marker"></td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div>=== Synopsis ===</div></td></tr> <tr><td class="diff-marker"></td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><br></td><td class="diff-marker"></td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><br></td></tr> <tr><td class="diff-marker" data-marker="−"></td><td style="color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div>erstellt ein Gaussian Inputfile für jede Struktur in einer xyz-Datei. Nützlich für</div></td><td class="diff-marker" data-marker="+"></td><td style="color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div>erstellt ein Gaussian Inputfile für jede Struktur in einer xyz-Datei <ins style="font-weight: bold; text-decoration: none;">sowie eine große Batchdatei mit je einem Aufruf von g03 für jede dieser Inputfiles</ins>. Nützlich für<ins style="font-weight: bold; text-decoration: none;">:</ins></div></td></tr> <tr><td class="diff-marker"></td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><br></td><td class="diff-marker"></td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><br></td></tr> <tr><td class="diff-marker"></td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div>* Annulenuntersuchungen,</div></td><td class="diff-marker"></td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div>* Annulenuntersuchungen,</div></td></tr> </table>

134.245.160.234 https://hergipedia.oc.uni-kiel.de/mediawiki/index.php?title=Xyz2com.tcl&diff=378&oldid=prev 2009-02-26T11:41:39Z

<p>Die Seite wurde neu angelegt: „=== Synopsis === erstellt ein Gaussian Inputfile für jede Struktur in einer xyz-Datei. Nützlich für * Annulenuntersuchungen, * FISE (nach Mutation durch [[xy...“</p> <p><b>Neue Seite</b></p><div>=== Synopsis ===<br /> <br /> erstellt ein Gaussian Inputfile für jede Struktur in einer xyz-Datei. Nützlich für<br /> <br /> * Annulenuntersuchungen,<br /> * FISE (nach Mutation durch [[xyz2cane.exe]]),<br /> * automatisierte Bearbeitung einer großen Anzahl Strukturen,<br /> * z.B. Konformerendatenbanken.<br /> <br /> === Installation ===<br /> * alle acid-Rechner<br /> * [http://scholle.oc.uni-kiel.de/herges/download/arbeiten/koehler_dissertation_2008_install.zip Download ]<br /> * Gitrepo: &#039;&#039;&#039;sftp://acid8/home/koehler/gitmaster/tcltk_thesis&#039;&#039;&#039;<br /> <br /> === Usage ===<br /> Kommandozeile. Beispiel:<br /> xyz2com -k &quot;pm3&quot; -c 0 -m 1 -g g98 -s c12_mmp_pm3.xyz<br /> <br /> === Longhelp ===<br /> xyz2com: 1.0.0<br /> (C) Felix Koehler 2004, 2007<br /> reads coordinates from an xyz - (Multistructure) - File<br /> and produces Gaussian input files, that will can be used to<br /> optimize each of these structures in a batch.<br /> Usage: tclsh xyz2com {options} xyzfile<br /> Options (all values have defaults):<br /> -k `keywordline` : keywordline for gaussian input files<br /> -c `charge` : charge for gaussian input files<br /> -m `multiplicity` : multiplicity for gaussian input files<br /> -g `gaussiancall` : command to start the gaussian program<br /> -V : print version and exit<br /> -f1 `singlefixedfile` : read a selectionfile containing all internal<br /> coordinates to remain fixed during optimization<br /> requires modredundant in keyword line<br /> -f2 `multifixedfile` :<br /> read a file with coordinates to remain fixed during<br /> optimization. One entry enclosed in<br /> STARTFIXED<br /> #<br /> ...<br /> ...<br /> ENDFIXED<br /> per structure of xyzfile<br /> -s : seq_from_xyz sequence nr from commentline of xyzfile</div>

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