Anewwrithm.exe: Unterschied zwischen den Versionen
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* Molekülnummer aus comment auslesen und in output. | |||
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: Fehler zu machen. | |||
* explizite Angabe des Ringes als Liste von Atomnummern. | |||
: ermöglicht Behandlung von Molekülen mit Dreifachbindungen. | |||
* CANE-Deskriptor errechnen und ausgeben. | |||
: generally nice to have. | |||
== Installation == | |||
* alle acid-Rechner (wahrscheinlich gerade veraltet) | |||
* http://134.245.135.211/anewwrithm/html/install.html | |||
* Gitrepo: '''sftp://acid8/home/koehler/gitmaster/cpp_thesis/anewwrithm''' | |||
== Usage == | |||
Kommandozeile. Beispiel: | |||
anewwrithem example.mol | |||
== Longhelp == | |||
Usage: anewwrithm <Options> <filename> | |||
Options: | |||
--verbose, -v : verbose output | |||
--help, -h : print help and exit | |||
Version vom 13. März 2009, 15:23 Uhr
Twist and Writhe in annulenes
Synopsis
Bestimmung von Twist, Writhe und Linking number in Molekülen.
http://134.245.135.211/anewwrithm/html/
Nützlich für:
- conformational search
- Annulene
ToDo / Work in progress
- Molekülnummer aus comment auslesen und in output.
- Sicherheitsmaßnahmen um beim Vergleich mit xyz2cane outputs keine
- Fehler zu machen.
- explizite Angabe des Ringes als Liste von Atomnummern.
- ermöglicht Behandlung von Molekülen mit Dreifachbindungen.
- CANE-Deskriptor errechnen und ausgeben.
- generally nice to have.
Installation
- alle acid-Rechner (wahrscheinlich gerade veraltet)
- http://134.245.135.211/anewwrithm/html/install.html
- Gitrepo: sftp://acid8/home/koehler/gitmaster/cpp_thesis/anewwrithm
Usage
Kommandozeile. Beispiel:
anewwrithem example.mol
Longhelp
Usage: anewwrithm <Options> <filename> Options: --verbose, -v : verbose output --help, -h : print help and exit