Turbomole: parallel rechnen: Unterschied zwischen den Versionen

Aus Hergipedia
Zur Navigation springen Zur Suche springen
Zeile 29: Zeile 29:
vor der ersten singlepoint:
vor der ersten singlepoint:


# ri Option aus control file entfernen
kdg ri
# Statistics run zur Berechnung der benötigten Memorygrößen
  stati dscf
  stati dscf
  nohup dscf > dscf.stat &
  nohup dscf > dscf.stat &

Version vom 24. März 2010, 18:26 Uhr

parallelisierte Module

parallelisiert nicht parallelisiert ???
dscf
ricc2
ridft
rimp2
grad
rdgrad
mpgrad

Usage

module switch turbomole/6.1 turbomole/6.1_mpi

dscf

vor der ersten singlepoint:

# ri Option aus control file entfernen
kdg ri

# Statistics run zur Berechnung der benötigten Memorygrößen
stati dscf
nohup dscf > dscf.stat &

dann scratchdir anlegen:

mkdir /scratch/koehler/abc123

im control file patchen:

$scfintunit
   unit=30       size=10000        file=/scratch/koehler/abc123/twoint
...
$tmpdir /scratch/koehler/abc123

und wie gehabt losschicken. Lohnt sich nur für große Basen/Moleküle.