Turbomole: parallel rechnen: Unterschied zwischen den Versionen
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== parallelisierte Module == | == parallelisierte Module (Stand 6.1) == | ||
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| dscf|||| | | dscf (HF nur ohne RI)|||| | ||
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== Usage == | == Usage == | ||
module switch turbomole/6.1 turbomole/6.1_mpi | |||
=== dscf === | === dscf === | ||
ist tatsächlich ohne ri auf 4 Proz. 4 x schneller für HF als ridft mit rijk | |||
(pf-Plattenspieler TZVP SP mit 6 Iterationen). | |||
2 Stunden vs 8 Stunden | |||
vor der ersten singlepoint: | vor der ersten singlepoint: | ||
# ri Option aus control file entfernen | |||
kdg ri | |||
# Statistics run zur Berechnung der benötigten Memorygrößen | |||
stati dscf | stati dscf | ||
nohup dscf > dscf.stat & | nohup dscf > dscf.stat & | ||
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und wie gehabt losschicken. Lohnt sich nur für große Basen/Moleküle. | und wie gehabt losschicken. Lohnt sich nur für große Basen/Moleküle. | ||
nohup dscf > dscf.out & | |||
Aktuelle Version vom 25. März 2010, 10:06 Uhr
parallelisierte Module (Stand 6.1)
| parallelisiert | nicht parallelisiert | ??? |
|---|---|---|
| dscf (HF nur ohne RI) | ||
| ricc2 | ||
| ridft | ||
| rimp2 | ||
| grad | ||
| rdgrad | ||
| mpgrad |
Usage
module switch turbomole/6.1 turbomole/6.1_mpi
dscf
ist tatsächlich ohne ri auf 4 Proz. 4 x schneller für HF als ridft mit rijk (pf-Plattenspieler TZVP SP mit 6 Iterationen). 2 Stunden vs 8 Stunden
vor der ersten singlepoint:
# ri Option aus control file entfernen kdg ri # Statistics run zur Berechnung der benötigten Memorygrößen stati dscf nohup dscf > dscf.stat &
dann scratchdir anlegen:
mkdir /scratch/koehler/abc123
im control file patchen:
$scfintunit unit=30 size=10000 file=/scratch/koehler/abc123/twoint ... $tmpdir /scratch/koehler/abc123
und wie gehabt losschicken. Lohnt sich nur für große Basen/Moleküle.
nohup dscf > dscf.out &