Version vom 15. März 2009, 10:48 Uhr

Molekülnummer aus comment auslesen und in output schreiben

Sicherheitsmaßnahmen um beim Vergleich mit xyz2cane outputs keine

Fehler zu machen.

ermöglicht Behandlung von Molekülen mit Dreifachbindungen.

Status

started on 15.3.2008

-Problem: Openbabel will switch numeration from 1 to 0 with next version (2.2 -> 3.0)

Ignorieren. Läuft dann halt nur mit 2.2.

-r filename

Format:

Kommentarzeilen beginnen mit #

enthält die Atomnummern der Selektion, separiert durch Leerzeichen.

read_ring_atomnumbers

liest obiges Fileformat und wandelt um in eine Openbabel-Ringdefinition.

hier bietet es sich an, aus den Strukturen eine Testsuite zu machen.

Wäre ja mal eine Möglichkeit, die CANEs unters Volk zu bringen.

Status: Die CANE Klassen existieren, müssen noch kopiert und angepasst werden.
ETA: ---
Version: 0.6

@@ Zeile 10: / Zeile 10: @@
 : ermöglicht Behandlung von Molekülen mit Dreifachbindungen.
-;Status: '''not started yet'''
+;Status: '''started on 15.3.2008'''
 ::: -Problem: Openbabel will switch numeration from 1 to 0 with next version (2.2 -> 3.0)
 ::: Ignorieren. Läuft dann halt nur mit 2.2.
+;Umsetzung
+*neue Kommandozeilenoption mit Dateinamen für Ringselektion
+:::-r filename
+::::Format:
+::::Kommentarzeilen beginnen mit #
+::::enthält die Atomnummern der Selektion, separiert durch Leerzeichen.
+*neue Funktion
+:::read_ring_atomnumbers
+::::liest obiges Fileformat und wandelt um in eine ''Openbabel''-Ringdefinition.
 ;ETA: 16.3.2008
 ;Version: 0.4