Roadmap für anewwrithm.exe
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Molekülnummer aus comment auslesen und in output schreiben
- Sicherheitsmaßnahmen um beim Vergleich mit xyz2cane outputs keine
- Fehler zu machen.
- Status
- FINISHED - und installiert auf den acids
- ETA
- 16.3
- Version
- 0.3
explizite Angabe des Ringes als Liste von Atomnummern
- ermöglicht Behandlung von Molekülen mit Dreifachbindungen.
- Status
- started on 15.3.2008
- -Problem: Openbabel will switch numeration from 1 to 0 with next version (2.2 -> 3.0)
- Ignorieren. Läuft dann halt nur mit 2.2.
- Umsetzung
- neue Kommandozeilenoption mit Dateinamen für Ringselektion
- -r filename
- Format:
- Kommentarzeilen beginnen mit #
- enthält die Atomnummern der Selektion, separiert durch Leerzeichen.
- -r filename
- neue Funktion
- read_ring_atomnumbers
- liest obiges Fileformat und wandelt um in eine Openbabel-Ringdefinition.
- read_ring_atomnumbers
- parse_commandline nervt. Eigenimplementation ohne GNU-Mist.
- ETA
- 17.3.2008
- Version
- 0.4
Verifikation mit komplettem Satz von Rzepas Moleküle
- Status
- not started yet
- ETA
- ---
- Version
- 0.5
Testsuite
- hier bietet es sich an, aus den Strukturen eine Testsuite zu machen.
- Status
- not started yet
- ETA
- ---
- Version
- 0.5.5
CANE-Deskriptor errechnen und ausgeben
- Wäre ja mal eine Möglichkeit, die CANEs unters Volk zu bringen.
- Status
- Die CANE Klassen existieren, müssen noch kopiert und angepasst werden.
- ETA
- ---
- Version
- 0.6