AICD: Gaussian Rechnung
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Für die Anwendung von AICD / ACID muss zunächst eine Gaussian-Rechnung mit einem gepatchten Gaussian durchgeführt werden. Dazu wird eine com-Datei erstellt, die als Rechnungstyp NMR=CSGT enthält.
VOR der Gaussian Rechnung muss auf den acid-Rechnern jetzt eine gepatchte Gaussianversion ausgesucht werden mithilfe des Befehls:
pick_gaussian
Es erscheint ein Menü, das alle installierten Gaussianversionen anzeigt, z.B.:
$ pick_gaussian Current gaussian version: ---> gaussian/g09.A02-emt64 <--- Available gaussian modules: 1) gaussian/g03.B04-32bit: adds Gaussian 03.B04, 32-bit with AICD-patch to your environment 2) gaussian/g03.D02-64bit: adds Gaussian 03.D02, 64-bit without AICD-patch to your environment 3) gaussian/g09.A02-emt64: Gaussian 09.A02 without AICD-patch, optimized for Intel 64bit processors 4) gaussian/g98.A11-32bit: adds Gaussian 98.A11, 32-bit with AICD-patch to your environment Pick the gaussian version you want to use during this login:
Eine Eingabe von 1 gefolgt von der Enter-Taste wählt jetzt eine der 32-bit Gaussianversionen (g03) mit Patch aus.
qsub g03 comfile.com
stellt die Rechnung in die persönliche Rechenqueue. Die erhaltene Logdatei enthält die induzierten Stromdichtetensoren.
Weiter gehts dann mit
AICD comfile.log
die AICD Kommandozeilenparameter sind dokumentiert in
AICD --help AICD --longhelp