Snp2xyz.exe

Aus Hergipedia
Zur Navigation springen Zur Suche springen

Synopsis

Transformiert eine Hyperchem snapshotfile Moleküldatenbank in eine xyz-Datei. Nützlich für:

  • conformational search
  • MD- und Monte-Carlo
  • Neurosuite
  • Annulene

Installation

  • im CIP-Pool
  • die meisten Arbeitsplatzrechner des AK
  • Download

Usage

Kommandozeile. Beispiel:

snp2xyz -p c12_mmp_csearch.snp c12_mmp_csearch.xyz

Longhelp

Usage: snp2xyz <snpfile> <xyzfile> {-option, ...}
  Converts a HYPERCHEM Snapshotfile into a multiple structures
  xyz file.
Options:
  -h/-?: this help
  -p: Potential Energy in comments on(default off)
  -t: Total Energy in comments on(default off)
  -a: Start index
  -z: Stop index
  -s: separate structures into single files: (default = off)
      xyzfile0.xyz, xyzfile1.xyz, xyzfile2.xyz, ...