RMSD-fit von Molekülen mit gOpenMol: Unterschied zwischen den Versionen

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=== Anzeige mit jmol ===
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[[Kategorie:Modellinganleitung]]
[[Kategorie:Anleitung]]

Aktuelle Version vom 24. Mai 2009, 12:55 Uhr

für einen RMSD-Fit von Strukturen mit dem Programm gOpenMol folgende Schritte ausführen:

Overlay

  • File/Import/Coords Datei1
  • File/Import/Coords (append) Datei2
  • Schlüsselatome aussuchen und zu equivalenten Atompaaren sortieren (Papier und Bleistift)
  • Calculate/Superimpose

Angabe der Schlüsselatompaare, z.B.:

Bei Atom (Structure1) z.B.: 1,3,5,67-100
Bei Atom (Structure2) z.B.: 2,4,6,68-101

Anzeige mit jmol

siehe NMR-Differenzen_zwischen_ähnlichen_Strukturen_als_interaktive_jmol-Grafik#Speichern_der_Isomere_als_je_eine_xyz-Datei